Cuando todas las capas de la córnea del paciente están dañadas realizamos un trasplante penetrante. En los casos en los que la enfermedad está más localizada podemos hacer trasplantes selectivos, es decir, si daña la capa más superficial, se realiza un SALK (Superficial Anterior Lamellar Keratoplasty). Sin embargo, si es más extenso y profundiza a través del estroma , se realiza un DALK (Deep Anterior Lamellar Keratoplasty). Por último, si el problema está únicamente en la parte más profunda, en el endotelio, realizamos un DMEK (Descemet Membrane Endothelial Keratoplasty).
De la misma manera, los ojos donantes son evaluados para seleccionar qué capas tienen sanas y cuáles cumplen los requisitos para convertirlas en tejido donante. Así, en el supuesto de que un donante tuviera una cicatriz en su estroma, todavía se podría aprovechar su endotelio para que otra persona pueda ver.
